Skibene vi bygger er først og fremmest lavet af træ. Hvert skib tager flere år at bygge, men så er alle detaljer til gengæld også fuldstændig genskabt og alt er lavet i hånden. Modellerne er bygget af ægte flådeeg, dvs. de ege, som kongen befalede at blive plantet, efter at englænderne tog den danske flåde i 1807. Gl. Kjøgegaard har nu fældet disse egetræer og doneret egetræ til mange modeller.
Men man har ikke altid brugt egetræ. Den maritime historie på Køge Havn, går langt tilbage. Faktisk lå der efter 1. verdenskrig hele to skibsværfter i byen. Her eksperimenterede man i efterkrigsårene med at bygge skibe i både jern og beton, fordi der ikke var så meget jern til rådighed efter 1. verdenskrig. Det viste sig imidlertid som en dårlig løsning. Skibene af beton var enormt klodsede og sank ganske enkelt.